The CENTRO DE ECOLOGIA FUNCIONAL é uma unidade de investigação financiada pela FCT alojada na Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade de Coimbra. O CEF ambiciona o aumento de conhecimentos sobre o funcionamento de ecossistemas, desde a biodiversidade de microorganismos, plantas e fauna, à complexidade ecológica das suas interacções ao nível da comunidade. O CEF encontra-se formalmente dividido em cinco grupos principais:

1 • BIODIVERSIDADE E EVOLUÇÃO
2 • ECOLOGIA DAS INVASÕES E INTERACÇÕES BIÓTICAS
3 • ECOFISIOLOGIA
4 • ECOLOGIA DE ECOSSISTEMAS MARINHOS E COSTEIROS
5 • ECOLOGIA E SOCIEDADE

Um novo grupo está em formação no âmbito da colaboração com o Laboratório de Ecologia Vegetal, em Areaia, Paraíba, sobre a Ecologia e Conservação do Ecossistema semi-árido da Caatinga, no Nordeste do Brasil